农业户口迁到非农户主下，户口性质通常会变为非农。分析：根据我国户籍管理制度，户口迁移时，户口性质往往会随迁入地的户口性质而改变。若原农业户口人员迁入非农户主名下，其户口性质一般会转变为非农业户口，享受非农户口相关的权益和待遇。提醒：若发现迁移后户口性质未如预期改变，或因此导致权益受损，表明问题可能比较严重，应及时咨询户籍管理部门或寻求法律专业人士的帮助。
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处理方式：从法律角度看，处理此类问题主要有两种方式：一是向户籍管理部门咨询并申请变更；二是若权益受损，可通过法律途径维权。选择建议：若仅涉及户口性质变更，建议首选向户籍管理部门咨询并申请；若因户口性质变更导致权益受损，可考虑通过法律途径维护自身合法权益。
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具体操作：1. 若需变更户口性质，应携带相关证件（如身份证、户口本、迁移证等）到迁入地户籍管理部门咨询并申请变更户口性质。2. 若因户口性质变更导致权益受损，如失去农业补贴、土地承包权等，可先尝试与相关部门协商解决；协商无果时，可收集证据（如政策文件、权益受损证明等），向当地法院提起诉讼，要求恢复原有权益或获得相应赔偿。3. 在整个过程中，应保留好所有与户口迁移、性质变更相关的文件和证据，以备不时之需。同时，注意了解相关法律法规和政策，确保自身权益不受侵害。